Mikroorganisma boleh didefinisikan sebagai sejenis makhluk hidup bersaiz kecil sehingga tidak dapat dilihat oleh mata manusia. Ini boleh terdiri daripada pelbagai jenis, antara yang paling penting adalah alga, kulat, bakteria, dll. Ada yang mempertahankan hipotesis bahawa beberapa mikroorganisma adalah pendahulu kehidupan di planet bumi, sementara anggapan lain yang lebih rumit menegaskan bahawa ini berasal dari luar bumi dan pada masa itu mereka meluas di atas muka bumi dan memberi kehidupan kepada semua yang ada sekarang. Secara amnya, mikroorganisma terdiri daripada sel unik, namun ini tidak bermaksud bahawa tidak ada yang terdiri daripada lebih dari satu sel.
Didorong oleh keperluan untuk menghadapi penyakit, kajian mikroorganisma mempunyai dorongan yang besar, kerana ini kerana perubatan berkembang dengan cara yang sama pengetahuan mengenai makhluk hidup ini.
Mikroorganisma tertentu dianggap bertanggungjawab untuk merugikan makanan tertentu, yang boleh membahayakan individu yang telah memakan makanan tersebut, menyebabkan pelbagai penyakit, walaupun terdapat mikroorganisma tertentu yang dapat menyumbang kepada prosedur yang berbeza, contohnya adalah fermentasi di mana organisma tersebut digunakan untuk membuat makanan seperti yogurt atau keju, iaitu, ada mikroorganisma yang dapat mengubah konfigurasi makanan tertentu atau bahkan memperpanjang jangka hayatnya.
Mikroorganisma yang mempunyai kehadiran terbesar di alam adalah bakteria, yang dapat dijumpai di pelbagai jenis habitat, ada bakteria yang boleh membahayakan kesihatan manusia, contohnya adalah " Escherichia coli ", yang bertanggungjawab untuk penyakit seperti septikemia. Walaupun demikian, ada bakteria lain yang dapat bermanfaat bagi tubuh, contohnya adalah "Lactobacillus acidophilus" yang mempunyai keupayaan untuk menghasilkan pelbagai bahan seperti vitamin K dan hidrogen peroksida yang dapat sangat membantu organisma.
