Mereka mewakili penyatuan dua atau lebih asid amino melalui hubungan antara yang asli dan peptida. Dalam produk dan protein, ikatan ini berkaitan dengan ikatan peptida dan hasil reaksi kumpulan karboksil, dengan kumpulan amino yang lain, dengan penghapusan molekul air.
The peptide bond (-CO-NH-) biasanya diwakili sebagai ikatan tunggal. Tanpa, bagaimanapun, mempunyai sejumlah ciri yang hampir sebagai ikatan berganda. Oleh kerana nitrogen kurang elektronegatif daripada oksigen, ikatan CO mempunyai watak ikatan berganda 60% sementara ikatan CN 40%. Oleh itu, ikatan CO dan NC ikatan peptida mempunyai ciri pertengahan antara ikatan tunggal dan ikatan berganda. Sebenarnya, jarak interatomik yang diukur dalam ikatan CO dan CN adalah perantara antara sambungan tunggal dan ikatan berganda. Susunan atom ini distabilkan oleh resonans, supaya enam atom yang terlibat dalam pembentukan ikatan peptida terkandung dalam satah yang sama.
Konsekuensi penting lain dari resonans adalah bahawa ia meningkatkan polaritas ikatan peptida dan mewujudkan momen dipol (gambar kanan dalam jadual di atas). Atas sebab ini, setiap ikatan peptida dapat mengambil bahagian dalam dua ikatan hidrogen. Di salah satu daripadanya, kumpulan -NH- bertindak sebagai penderma hidrogen dan yang lain, kumpulan -CO- bertindak sebagai reseptor hidrogen. Properti ini memberi sumbangan besar kepada lipatan protein tiga dimensi, seperti yang akan kita lihat kemudian.
The separa sifat ikatan kembar menghalang putaran bebas bon yang menyertai atom C dan N dalam ikatan peptida. Kekakuan ikatan berganda ini menghadkan kemungkinan konformasi peptida. Terdapat dua kemungkinan konfigurasi:
- Konfigurasi Cis: kedua-dua Ca berada di sisi ikatan berganda yang sama.
- Konfigurasi trans: kedua-dua Ca berada pada sisi ikatan berganda yang berbeza.
Perlu diperhatikan bahawa, secara umum, ikatan peptida diwakili sebagai ikatan tunggal. Bagaimanapun, ia mempunyai beberapa ciri yang menjadikannya hampir dengan ikatan berganda. Itulah sebabnya para pakar secara umum menyebutkan bahawa ikatan peptida mempunyai sifat yang meletakkannya di antara ikatan tunggal dan ikatan berganda.
